RNA World

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RNA World ist ein Projekt, das sich mit der Identifizierung von nicht proteinkodierender RNA auseinandersetzt und durch Einsatz diverser RNA-relevanter bioinformatischer Softwarepakete RNA-Forschung vorantreiben möchte. Es ist innerhalb des Vereins Rechenkraft.net e.V. entstanden und wird ausschließlich von Freiwilligen betrieben. Kooperationspartner sind die Philipps-Universität Marburg und das Indian Institute of Science in Bangalore (Indien), weitere Kooperationspartner sind erwünscht. Wissenschaftler, die Vorschläge für eine bestimmte RNA-relevante Software zwecks Integration in den RNA World Distributed Supercomputer haben, sind herzlich eingeladen uns zu kontaktieren.

Zur Nutzung der VM-Applikation ist mindestens ein BOINC client 7.2.33 sowie die VirtualBox 4.0.10 nötig. Diese Anwendung läuft nur auf x64-Systemen.

RNA World
Beginn 2009
Ende
Status beta
Admin yoyo
Institut RKN
Land Deutschland
Bereich Biologie
Anwendungen
Win cmsearch S (short) 1.0.2 0.32
cmsearch XXL 1.0.2 0.32
cmsearch XXL (long) 1.0.2 0.32
Linux cmsearch S (short) 1.0.2 0.31
cmsearch XXL 1.0.2 0.31
cmsearch XXL (long) 1.0.2 0.31
Mac cmsearch S (short) 1.0.2 0.30cmsearch XXL 1.0.2 0.30
64bit cmsearch S (short) 1.0.2 0.32 [win/linux]
cmsearch XXL 1.0.2 0.32 [win/linux]
cmsearch XXL (long) 1.0.2 0.32 [win/linux]
cmcalibrate 1.0.2 0.22 [linux]
cmalign 1.0.2 0.01 [linux]
cmbuild 1.0.2 0.01 [linux]
cmsearch VM (VirtualBox) 1.0.2 1.14/1.13 (vbox64) [win/linux/mac]
PS3
ATI
CUDA
Intel
Android
RPi
NCI
Systemspezifikationen
VRAM SP DP
RAM >300MB - 1GB
Laufzeit 1min - 500h
HDD 21MB
Traffic dl/ul MB / kb
Deadline 10 Tage
Checkpoints