Lattice: Unterschied zwischen den Versionen

Aus BC-Wiki
Zur Navigation springen Zur Suche springen
Keine Bearbeitungszusammenfassung
K (Code-Korrektur)
 
(48 dazwischenliegende Versionen von 5 Benutzern werden nicht angezeigt)
Zeile 1: Zeile 1:
{{Projekte
{{Languages|Lattice}}
 
{{Projekte-ws
|Projekt-Link=[http://boinc.umiacs.umd.edu/ Lattice]
|Projekt-Link=[http://boinc.umiacs.umd.edu/ Lattice]
|Screensaver=                                       <!--bildname.xxx-->
|Screensaver=na.png
|Projektbeschreibung=[[Bild:lattice-logo.gif|left]]
|Projektbeschreibung=[[Bild:lattice-logo.gif|left]]
The Lattice Project ist ähnlich wie das World Community Grid kein eigenständiges Distributed Computing Projekt, sondern eine komplexe Grid-Infrastruktur, die von Forschern der Universität von Maryland entwickelt wurde und in der diverse Projekte ablaufen können. Das Interessante an Lattice Project ist die Verschmelzung von GLOBUS mit Condor und BOINC. Seit Entwicklungsbeginn im Jahre 2003 sind insgesamt 21 bereits existierende Bioinformatik-Tools auf das Lattice Project portiert worden. Darunter sind unter anderem Sequenzalignmentprogramme wie BLAST und ClustalW, Programme zur Vorhersage von RNA Strukturen (Pknots), sowie eine ganze Serie von Tools zur phylogenetischen Analyse (PAUP, LAMARC, PHYLM, usw.). Hintergrund dieser Bemühungen ist der immense Rechenbedarf moderner bioinformatischer Analysen.


|Beginn=2005
|Beginn=2005
|Ende=
|Ende=2017
|Status=beta
|Status=eingestellt
|Bereich=[[BOINC_Projekte#Grid/Informatik|Grid/Informatik]]
|Admin=Adam Bazinet, Michael Cummings
|Windows-Versionen=garli 5.06<br>HMMPfam 5.03
|Institut=University of Maryland - Laboratory of Molecular Evolution
|Linux-Versionen=garli 5.07<br>HMMPfam 5.02
|Land=USA
|Mac-Versionen=garli 5.05<br>HMMPfam 5.01
|Bereich=[[BOINC-Projekte#Grid/Informatik|Grid/Informatik]]
|RAM=15MB
|Windows=GARLI 5.05
|Laufzeit=7min-1:15h
|Linux=GARLI 5.05
|Mac=
|64bit=GARLI 5.06 [win/linux]/GARLI 5.04 [mac]
|PS3=
|ATI=
|CUDA=
|Intel=
|Android=no
|RPI=no
|NCI=no
|VRAM=
|SP=no
|DP=no
|RAM=300-400MB / 15MB
|Laufzeit=11min-3h / 15min
|Festplattenplatz=2,8MB
|Festplattenplatz=2,8MB
|Traffic=5,4MB / kb
|Traffic=5,4MB / kb
|Deadline=3 Tage
|Deadline=4 Tage / 3 Tage
|Checkpoints=nein
|Checkpoints=yes
}}
}}
{{Languages|Lattice}}

Aktuelle Version vom 13. Mai 2018, 10:15 Uhr

The Lattice Project ist ähnlich wie das World Community Grid kein eigenständiges Distributed Computing Projekt, sondern eine komplexe Grid-Infrastruktur, die von Forschern der Universität von Maryland entwickelt wurde und in der diverse Projekte ablaufen können. Das Interessante an Lattice Project ist die Verschmelzung von GLOBUS mit Condor und BOINC. Seit Entwicklungsbeginn im Jahre 2003 sind insgesamt 21 bereits existierende Bioinformatik-Tools auf das Lattice Project portiert worden. Darunter sind unter anderem Sequenzalignmentprogramme wie BLAST und ClustalW, Programme zur Vorhersage von RNA Strukturen (Pknots), sowie eine ganze Serie von Tools zur phylogenetischen Analyse (PAUP, LAMARC, PHYLM, usw.). Hintergrund dieser Bemühungen ist der immense Rechenbedarf moderner bioinformatischer Analysen.

Lattice
Beginn 2005
Ende 2017
Status eingestellt
Admin Adam Bazinet, Michael Cummings
Institut University of Maryland - Laboratory of Molecular Evolution
Land USA
Bereich Grid/Informatik
Anwendungen
Win GARLI 5.05
Linux GARLI 5.05
Mac
64bit GARLI 5.06 [win/linux]/GARLI 5.04 [mac]
PS3
ATI
CUDA
Intel
Android
RPi
NCI
Systemspezifikationen
VRAM SP DP
RAM 300-400MB / 15MB
Laufzeit 11min-3h / 15min
HDD 2,8MB
Traffic dl/ul 5,4MB / kb
Deadline 4 Tage / 3 Tage
Checkpoints