Hydrogen@home

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Die Hypothese von Jack ist, ob Computersimulationen die Wechselwirkung von kleinen Molekülen modellieren können, um katalytische Wechselwirkungen vorhersagen zu können und ob diese Art der Simulation vorher uncharakteristische Katalysatoren aus einer "Bibliothek" von Proteinstrukturen enthüllen können. Die Grundlage dieser Hypothese sind die benötigten Simulationen, um Enzym-Hemmstoffe zu identifizieren, wie bei FightAids@Home demonstriert wurde. Enzym-Wechselwirkungen zu finden ist jedoch sehr unterschiedlich.

Der plausibelste Weg, um diese Wechselwirkung zu modellieren, muß zwischen dem Übergangsstadium einer Reaktion und der aktiven Seite liegen, die auch während der Reaktion stört. Wie alle diese Wechselwirkungen modelliert werden können, ist noch ein Mysterium, das einen langen Weg bedeutet, bis das Projekt eine anschauliche Proteindatenbank darstellen kann.

Hydrogen@home
Beginn 2007
Ende ?
Status beta
Admin Jack Shultz (jackygrahamez@gmail.com), Aaron George Pollock
Institut -
Land USA
Bereich Chemie
Anwendungen
Win autodock w/MGL Tools 1.56
mdrun 7.42
Linux autodock w/MGL Tools 2.16
mdrun 1.26
Mac autodock w/MGL Tools 4.14
mdrun 4.11
64bit autodock w/MGL Tools 5.13 [linux]
mdrun 2.20 [linux]
PS3
ATI
CUDA mdrun with cuda 0.31 [win]
Intel
Android
RPi
NCI
Systemspezifikationen
VRAM SP DP
RAM
Laufzeit 2min
HDD 75MB
Traffic dl/ul MB / kb
Deadline
Checkpoints